Química computacional en AstraZeneca

La empresa farmacéutica mundial tiene como objetivo llevar medicamentos nuevos al mercado de manera más rápida

DesafíoRecopilar y analizar enormes cantidades de datos en un entorno de descubrimiento de fármacos.
SoluciónJMP® permite a los químicos computacionales de AstraZeneca manipular y analizar grandes conjuntos de datos para ayudar a identificar las moléculas activas para un objetivo específico.
ResultadosLos científicos de AstraZeneca aprovechan al máximo las capacidades de visualización y análisis de JMP para llevar a cabo investigaciones de forma más rápida y eficaz, lo que ayuda a la empresa a llevar medicamentos de calidad al mercado con mayor rapidez.

Manipular conjuntos de datos que a veces contienen hasta un millón de filas es una tarea de enormes proporciones, una tarea que resulta mucho más fácil para los químicos computacionales de AstraZeneca con la ayuda de JMP en el trabajo.

"Tenemos grandes cantidades de diferentes tipos de datos que necesitan combinarse y analizarse de una manera sólida", explica la Dra. Paula Kitts, química computacional de AstraZeneca en Alderley Park, Inglaterra.

Kitts se dedica al uso de la modelización de proteínas y moléculas pequeñas para ayudar en el diseño molecular. Básicamente, se trata del descubrimiento de fármacos. "En realidad, la parte relacionada con la química computacional implica tratar de ver aquello que podemos calcular computacionalmente o tratar de construir modelos estadísticos para predecir aspectos que ayuden a los químicos a decidir qué hacer luego. Tratamos de ayudarles a diseñar moléculas que sean potencialmente activas para un objetivo en particular", explica.

Debido a que esto implica la recopilación de grandes cantidades de datos, los químicos computacionales están especialmente interesados en las herramientas y técnicas de análisis de datos que se encuentran en JMP. El software les permite recopilar rápidamente grandes y complicados conjuntos de datos, y presenta la información de una manera visualmente atractiva y fácil de leer para que puedan ver patrones o problemas con rapidez. "Es muy, muy rápido. Se puede hacer el trabajo en otro software, pero no todo está en un solo lugar", dice Kitts. "Con JMP, se puede usar un solo software para hacer todo, cuando antes usábamos tres o cuatro programas diferentes".

La investigación de los químicos computacionales juega un papel crucial en su trabajo en equipos de proyectos multidisciplinarios que incluyen químicos medicinales, biocientíficos y químicos físicos.

Ser capaz de investigar de manera más eficaz es clave para ayudar a esta empresa farmacéutica líder mundial en su búsqueda de introducir con mayor rapidez en el mercado nuevos medicamentos diseñados para combatir enfermedades en áreas como la gastrointestinal, cardiovascular, respiratoria, neurociencias, inflamación, cáncer e infección.

El aumento de las capacidades mejora la eficiencia

Gran parte de lo que sustenta el trabajo que los científicos de AstraZeneca emprenden es la manipulación de datos. Ese es el motivo por el cual la compatibilidad de JMP con muchas fuentes de datos permite la interrogación directa de los datos de descubrimiento. "Puedo abrir cualquier tabla de datos sin tener que procesar esos datos de ninguna forma. Puedo reunir todos los datos usando JMP, y luego puedo manipularlos y transformarlos rápidamente yo misma", explica Kitts. "Eso no era siempre posible con los otros softwares que usábamos".

El acceso a la base de datos ayuda especialmente, por ejemplo, cuando AstraZeneca utiliza JMP en el cribado de alto rendimiento. "Probamos la colección de compuestos corporativos en relación con objetivos concretos y podemos llegar a tener hasta un millón de filas de datos para un objetivo concreto que nos interesa. Obviamente, poder abrirlos directamente en JMP nos resulta útil", dice Kitts.

La posibilidad de abrir los datos directamente desde la base de datos utilizando JMP también ahorra tiempo: significa abrir una tabla en lugar de innumerables tablas. Kitts cita un ejemplo en el que tenía seis compuestos en 15 pruebas diferentes. "Es de imaginar que si tuviera que abrir tantas tablas grandes, sería espantoso", dice. En cambio, puede obtener una vista de todos los datos a través de JMP. Con una mirada rápida, puede ver si algo ha salido mal en una prueba en particular.

Debido a que JMP es tan rápido de usar, también ayuda a los científicos a realizar escenarios hipotéticos. "Se pueden probar muchas cosas diferentes. Se puede hacer una investigación para ver qué datos arroja. Si se ha cometido un error, es tan rápido que se la puede repetir".

Sin dudas, JMP nos permite ahorrar tiempo. Un buen ejemplo es la función de scripts de JMP utilizada para realizar procesos repetitivos, por ejemplo, si se desea realizar un análisis particular una vez a la semana. "Una vez que se decide cuál es el análisis, se lo puede guardar y volver a ejecutarlo, sin tener que pensar en ello cada vez que sea necesario", explica Kitts. Podría llevarle una hora hacer un análisis. Pero la próxima vez, como ya ha guardado el script, le llevará un minuto o menos, lo que le permitirá ahorrar una hora cada vez que necesite repetir el análisis con nuevos datos.

Avanzando

AstraZeneca es cliente de SAS desde hace mucho tiempo y continúa utilizando SAS en muchas áreas diversas, incluidas estadística de descubrimiento, bioestadística y programación clínica. Con el tiempo, la empresa también ha incrementado el uso de JMP en química computacional y continúa expandiendo su uso entre los químicos medicinales y físicos de este departamento. Esta expansión se debe principalmente a que Kitts y los otros 120 usuarios de JMP en Alderley Park descubrieron que el software es rápido e intuitivo. Según Kitts, los químicos computacionales de AstraZeneca, en particular, disfrutan del hecho de que no necesitan escribir programas cuando utilizan JMP, lo que les ahorra tiempo y esfuerzo.

Kitts ha estado usando JMP desde que comenzó a trabajar en AstraZeneca en 1997. Durante ese tiempo, el software ha pasado por varias actualizaciones. "Hemos mejorado y actualizado JMP. Tiene un aspecto similar, pero resulta evidente dónde están las mejoras. Y siempre está mejorando".

JMP ha tenido tanto éxito a la hora de ayudar a los químicos computacionales de AstraZeneca en Alderley Park que la empresa está promoviendo el uso del software en otros grupos. La empresa ofrece ahora su propia capacitación en JMP. Los atributos de fácil uso del software son especialmente útiles cuando AstraZeneca capacita nuevos usuarios.

"JMP es fácil de usar, incluso si nunca se lo ha visto antes", dice Kitts. "Por lo general, las personas nuevas no necesitan asistir a la capacitación, aunque contamos con cursos de capacitación en nuestras instalaciones. Hemos visto que solo necesitamos sentarnos con los principiantes durante media hora para que lo entiendan".

Y los científicos de AstraZeneca han aprendido rápidamente que JMP les permite realizar sus investigaciones de forma más eficaz y rápida, lo que convierte al software en una parte necesaria de su lugar de trabajo. "En algunos casos", dice Kitts, "no sé cómo haría el trabajo si no tuviera JMP".


En algunos casos, no sé cómo haría el trabajo si no tuviera JMP.
Dra. Paula Kitts

Química computacional
AstraZeneca
Alderley Park, Inglaterra

Enlaces adicionales
Comuníquese con el departamento de ventas de JMP

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