JMP® Genomics
Ce logiciel avancé d’analyse des données génomiques vous aide à visualiser vos données et à multiplier les découvertes
Que vous travailliez dans l’agriculture, la pharmacogénomique, les biotechnologies ou tout autre domaine de la recherche génomique, JMP Genomics permet d’analyser des variantes rares et courantes, de détecter des configurations d'expression différentielle, de repérer des signaux dans les données de séquençage de nouvelle génération (ou NGS, Next Generation Sequencing), de découvrir des profils de biomarqueurs fiables et de visualiser des configurations via des workflows intégrés d'analyse des données génomiques.
Vous avez quelques minutes ? Découvrez JMP Genomics à l'œuvre.
Phytogénéticiens et bio-scientifiques
Le besoin de pratiques agricoles innovantes et durables est l’une des grandes préoccupations du monde actuel. JMP Genomics permet aux phytogénéticiens et bio-scientifiques de sélectionner des cultures plus saines en modélisant la variabilité génétique, en optimisant la sélection, en simulant des programmes de sélection de plusieurs caractères et en arbitrant entre les principaux caractères souhaités.
Spécialistes des biomarqueurs
Les progrès technologiques permettent à présent aux spécialistes des biomarqueurs de collecter un maximum de données sur la réponse aux médicaments et la biologie des maladies. Il n’a cependant jamais été aussi compliqué d’extraire des informations statistiquement correctes de toutes ces données. JMP Genomics vous aide à explorer visuellement les fondements génétiques de la maladie et de la réponse aux médicaments, à concevoir et analyser des expériences complexes, et à réaliser des études reproductibles.
Généticiens statisticiens
Grâce à l’essor du génotypage, les généticiens statisticiens, qui ont à présent accès à des données génotypiques d'une grande richesse, peuvent analyser rapidement et à moindre coût l'origine génétique d’une maladie. JMP Genomics vous permet de lire des études d'association pangénomiques, d’explorer la structure et la variabilité génétiques à l’aide de modèles d’associations statistiques avancés, et d’identifier et de comprendre des variantes rares.
Fonctionnalités de base de JMP Genomics®
Sélection génomique pour l’amélioration des cultures
Étudiez les interactions entre génotype et environnement, et identifiez les combinaisons de marqueurs optimales pour produire les caractères souhaités et simuler la descendance des croisements potentiels.
Pharmacogénomique
Analysez les configurations génomiques intégrées à partir de l’expression de l’ADN, de l’ARN, des métabolites et des protéines pour connaître le rôle de la biologie dans les maladies et la réponse aux médicaments.
Expression
Analysez les données de séquençage de l’ARN et de puce à ADN via des workflows de type pointer-cliquer adaptés au contrôle qualité, à la normalisation et aux modèles ANOVA pour l’expression différentielle des gènes et des exons.
Statistique génétique
Examinez les associations à l’aide de fonctions très complètes d’étude d'association pangénomique. Appliquez différentes techniques allant des simples analyses d'association de cas-témoins aux modèles mixtes complexes, et contrôlez facilement la structure de la population et les liens de parenté cryptiques.
Séquencement de nouvelle génération
Simplifiez l’analyse statistique des données de nouvelle génération à l’aide de différents workflows et de méthodes de modélisation adaptés.
Cartes de liaisons
Créez des cartes de liaisons optimales pour les populations expérimentales, visualisez les cartes de marqueurs et procédez à des analyses QTL détaillées.
Modélisation prédictive
Identifiez des biomarqueurs à partir de jeux de données hautement dimensionnels. Créez et comparez différents modèles pour plusieurs caractères en procédant à des modélisations prédictives à validation croisée à l’aide des fonctions de criblage des régresseurs.