JMP® Genomics
Software per l’analisi genomica avanzata che permette di visualizzare e approfondire i dati
Indipendentemente dal settore di attività (agricoltura, farmacogenomica, biotecnologie o altre aree della ricerca genomica), JMP Genomics fornisce gli strumenti giusti per l'analisi delle varianti comuni e rare, il rilevamento di pattern dell'espressione differenziale, il sequenziamento di prossima generazione con individuazione dei segnali, l'esplorazione di profili affidabili dei marcatori biologici, nonché la visualizzazione di pattern attraverso flussi di lavoro di analisi genomica integrati.
Avete un minuto di tempo? Osservate JMP Genomics in azione.
Coltivatori di piante e bioscienziati delle colture
La necessità di pratiche agricole innovative e sostenibili è una delle preoccupazioni più urgenti del mondo. JMP Genomics consente ai coltivatori di piante e ai bioscienziati delle colture di selezionare colture più sane, modellando la variabilità genetica, ottimizzando la scelta delle colture, simulando programmi di incrocio multiplo e bilanciando i compromessi tra le varie caratteristiche principali desiderate.
Ricercatori di biomarcatori
I progressi tecnologici consentono ai ricercatori di biomarcatori di raccogliere più dati che mai sulle risposte ai farmaci e sulla biologia delle malattie. Ma è pur vero che estrarre informazioni statisticamente valide da tutti questi dati non è mai stato così difficile. JMP Genomics consente di esplorare visivamente le basi genetiche della risposta patologica e farmacologica, di progettare e analizzare esperimenti complessi e di condurre ricerche riproducibili.
Esperti di statistica genetica
Con l'insorgere di tecnologie di genotipizzazione sempre più rapide e convenienti, gli esperti di statistica genetica ora sono subissati di dati avanzati sui genotipi con cui possono indagare le basi genetiche delle malattie. JMP Genomics consente di analizzare studi complessi sull'associazione dell'intero genoma (GWAS, Genome-Wide Association Studies), esplorare la variabilità e la struttura genetica con modelli di associazione statistica avanzati e identificare e comprendere varianti rare.
Funzionalità principali di JMP Genomics®
Selezione genomica per il miglioramento delle colture
Esplorate le interazioni genotipo-ambiente e scoprite combinazioni ottimali di marcatori per produrre caratteristiche desiderate e simulare la progenie di potenziali incroci.
Genomica farmacologica
Analizzate pattern genomici integrati dall’espressione di DNA, RNA, metaboliti e proteine per individuare i ruoli biologici nella risposta alle malattie e ai farmaci.
Espressione
Analizzate studi di microarray o RNA-seq attraverso flussi di lavoro estremamente intuitivi progettati appositamente per il controllo qualità, la normalizzazione e la modellazione ANOVA per l'espressione differenziata a livello di geni ed esoni.
Statistica genetica
Esaminate le associazioni con funzionalità GWAS complete. Applicate tecniche che spaziano dalla semplice associazione per il controllo dei casi a modelli misti complessi e controllate facilmente la struttura della popolazione e la correlazione criptica.
Sequenziamento di prossima generazione
Ottimizzate l'analisi statistica dei dati di prossima generazione attraverso diversi metodi di modellazione e flussi di lavoro personalizzati.
Mappatura delle associazioni
Create mappe di associazioni ottimali per popolazioni sperimentali, visualizzate mappe di marcatori ed eseguite analisi QTL estese.
Modelli predittivi
Identificate i biomarcatori a partire da set di dati pluridimensionali. Costruite e confrontate più modelli per più caratteristiche attraverso la revisione di modelli predittivi con crossvalidation grazie ad avanzate funzionalità di screening dei predittori.