标记模拟的示例
了解如何从基因数据模拟遗传杂交。
1. 选择帮助 > 样本数据文件夹 > Life Sciences，然后打开 Genotypes Pedigree.jmp 和 Genotypes Pedigree Anno.jmp。
2. 点击 Genotypes Pedigree.jmp 表。
3. 选择表中的前二十行。
注意：该示例仅分析前二十行。
4. 选择行 > 行选择 > 反转行选择。
5. 选择行 > 排除/撤销排除以从分析中排除前二十行之外的所有行。
6. 选择分析 > 遗传学 > 标记模拟。
7. 选择 Markers (60/0) 并点击标记。
8. 选择预测公式: 性状1、预测公式: 性状2、预测公式: 性状3、预测公式: 性状4 和概率（疾病状态=1），然后点击预测变量公式。
9. 选择性别，然后点击杂交。
10. 为倍性输入 2。
11. 为每次杂交的个体数输入 5。
12. 为遗传世代数输入 2。
13. 选中使用注解表、使用仅在预测变量公式中找到的标记和估计多样性复选框。
14. 为缺失标记插补方法选择随机。
15. 在“高级选项”下，为设置随机种子输入 123。
16. 选中非线程复选框。
17. 点击确定。
18. 在“选择注解表”窗口中，选中 Genotypes Pedigree Anno.jmp 注解数据表。
19. 在“注解规格”窗口中，选择标记并点击标记变量。
20. 选择基因并点击注解组。
21. 选择基因连锁位置并点击注解位置。
22. 点击确定。
生成“标记模拟”报表。
23. 点击“标记模拟”红色小三角并选择显示评估图和显示多样性图以生成图 4.1 中所示的报表。
图 4.2 模拟杂交的结果
“标记模拟”报表包含以下信息：
• “模拟汇总”汇总在平台上所做的选择以及运行模拟所花费的时间。
• “世代的评估表”提供每个跨世代的杂交的基因型和等位基因统计量以及预测的性状统计量。
• “散点图矩阵”显示每个杂交的性状的配对比较。
• “世代的性状评估图”显示每个跨世代的杂交在平均性状值中的变化。
• “世代的多样性评估图”显示多态、杂合度和等位基因多样性和频率如何跨世代变化。