표지자 통계량 플랫폼의 추가 예

유전자 데이터에서 연관비평형 통계량을 계산하는 방법을 알아봅니다.

1. 도움말 > 샘플 데이터 폴더 > Life Sciences를 선택하고 Genotypes Pedigree.jmp 및 Genotypes Pedigree Anno.jmp를 엽니다.

2. 분석 > 유전학 > 표지자 통계량을 선택합니다.

3. "Markers" 표시 아이콘을 클릭하여 표지자 열을 표시합니다.

4. 처음 10개의 표지자 열을 선택하고 표지자를 클릭합니다.

5. 동일한 10개의 표지자를 선택하고 연계 표지자를 클릭합니다.

6. 주석 테이블 사용 체크박스를 선택합니다.

7. 확인을 클릭합니다.

8. "주석 테이블 선택" 창에서 Genotypes Pedigree Anno.jmp 주석 데이터 테이블을 선택합니다.

9. "주석 지정" 창에서 Marker를 선택하고 표지자 변수를 클릭합니다.

10. Gene를 선택하고 주석 그룹을 클릭합니다.

11. Physical Position을 선택하고 주석 위치를 클릭합니다.

12. 확인을 클릭합니다.

그림 3.4 연관비평형 분석 

"결과 테이블"에서 각 표지자 쌍에 대해 표시된 값은 표지자 쌍 간의 연관비평형 강도를 나타냅니다. "LD 붕괴 그림"에서는 표지자 사이의 거리가 증가함에 따라 연관비평형이 지수적으로 감소하는 것을 볼 수 있습니다.

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