결측 표지자 대치의 예

JMP 테이블에서 결측 표지자 데이터의 대치 방법을 알아봅니다.

1. 도움말 > 샘플 데이터 폴더를 선택하고 Life Sciences > Genotypes Pedigree.jmp를 차례로 엽니다.

Genotypes Pedigree.jmp 테이블에 결측 데이터가 없으므로 이 예에서는 표지자 데이터 열(CG1SNP1 ~ CG1SMP30) 중 처음 14개 열에서 17개 셀을 무작위로 선택하여 각 셀의 데이터를 지웠습니다. 그 결과로 해당 셀에 모두 결측 데이터 기호(•)가 포함되었습니다. 이 테이블은 아래에 표시된 GENOTYPES pedigree_MissingData.jmp 테이블로 저장되었습니다. 데이터가 결측인 모든 셀에는 결측 데이터 기호(•)가 포함되어 있습니다. 이러한 셀은 아래 그림에서 원으로 표시되어 있습니다.

그림 7.2 결측 데이터가 포함된 Genotypes Pedigree_MissingData.jmp 테이블 

2. 분석 > 생명 과학 > 결측 표지자 대치를 선택합니다.

3. "Markers"를 선택하고 표지자를 클릭합니다.

4. 확인을 클릭합니다.

이 플랫폼은 결측 데이터를 평가하고, 선택한 결측값 대치법에 따라 결측 유전자형 데이터를 대체한 후 아래 표시된 것처럼 테이블의 빈 공간에 새 유전자형을 추가합니다.

그림 7.3 완성된 테이블 

완성된 테이블에서 대치된 유전자형은 원 안에 표시되어 있습니다.