결측 표지자 대치

결측 표지자 대치 플랫폼은 LD-kNNi(연관비평형 k 최근접 이웃 대치법)나 기타 방법을 사용하여 이배체(K = 2) 또는 배수체(K > 2) 생물의 수치형 결측 표지자 유전자형(0, 1, ..., K)을 대치합니다. 결측 유전자형을 가진 표지자와 다른 모든 표지자 사이의 거리(Pearson 상관)를 계산하고, 결측 유전자형을 가진 각 표지자에 대해 가장 가까운 표지자 집합이 선택됩니다. 그런 다음 선택된 각 표지자 집합을 사용하여 결측 유전자형을 가진 표본과 다른 모든 표본 사이의 거리(맨해튼 거리, taxi cab)를 계산합니다. 마지막으로 가장 가까운 표본 및 표지자 집합을 사용하여 결측 유전자형을 대치합니다(Money et al., 2015 참조).

참고: 결측 표지자 대치 플랫폼은 JMP Pro에서만 사용할 수 있습니다.

그림 7.1 유전 표지자 데이터가 포함된 테이블의 결측 데이터 분석 예