了解如何在 JMP 表中插补缺失标记数据。
1. 选择帮助 > 样本数据文件夹,然后依次打开 Life Sciences 和 Genotypes Pedigree.jmp。
Genotypes Pedigree.jmp 表中不含任何缺失数据,因此在本例中,我们人为制造了一些缺失数据:在标记数据的前 14 列(列 CG1SNP1 一直到列 CG1SMP30)中随机选择了 17 个单元格,并清除了其中每个单元格的数据。结果,这些单元格均包含缺失数据符号 (•)。该表被另存为 GENOTYPES pedigree_MissingData.jmp 表(如下所示)。所有包含缺失数据的单元格均包含一个缺失数据符号 (•)。这些单元格在下图中用圆圈标出。
图 7.2 包含缺失数据的 Genotypes Pedigree_MissingData.jmp JMP 表
2. 选择分析 > 生命科学 > 标记插补。
3. 选择“标记”并点击标记。
4. 点击确定。
该平台会评估缺失数据,并根据所选的插补方法,插补缺失的基因型数据,并将插补后的基因型添加到该表的空单元格中,如下图所示。
图 7.3 完成的表
完成的表中的已插补基因型用圆圈标记。