标记插补

“标记插补”平台使用连锁不平衡的 k 最近邻插补法 (LD-kNNi) 或其他方法，为二倍体（其中 K=2）或多倍体 (K>2) 生物体插补数值型缺失标记基因型 (0, 1, ..., K)。首先计算缺失基因型的标记与所有其他标记之间的距离（Pearson 相关性），并为每个缺失基因型的标记选择一组最近的标记。接下来，使用相应的选定标记集合来计算缺失基因型的样本与所有其他样本之间的距离（出租车距离）。最后，使用最近的样本和标记的集合来插补缺失的基因型（请参见 Money et al., 2015）。

注意：仅在 JMP Pro 中提供“标记插补”平台。

图 7.1 对包含遗传标记数据的表中的缺失数据进行分析的示例