「マーカーの統計量」の例

次のような手順で、分析対象の遺伝子データからマーカーの統計量を計算してみましょう。

1. ［ヘルプ］>［サンプルデータフォルダ］>「Life Sciences」を選択し、「Genotypes Pedigree.jmp」を開きます。

2. ［分析］>［遺伝学］>［マーカーの統計量］を選択します。

3. 「Markers」の開閉アイコンをクリックしてマーカーの列を表示します。

4. 最初の10個のマーカー列を選択し、［マーカー］をクリックします。

5. ［OK］をクリックします。

図3.2 「マーカーの統計量」レポート 

「結果の表」には、分析した各マーカーの統計量が表示されます。結果の表を参照してください。

Hardy-Weinberg平衡プロットは、各マーカーがどれだけ平衡状態に近いかを示します。x軸上には、列番号がプロットされます。この列番号は、分析対象のJMPデータテーブルにおける、列に対する通し番号です。y軸には、各マーカーのFDR対数価値と対数価値がプロットされます。参照線より点が上にある場合、マーカーが平衡状態にないことを示唆しています。参照線から上に点が離れているほど、該当のマーカーが平衡状態にないことを示す証拠が強いです。

メモ: 水準表や度数表を表示するには、「マーカーの統計量」の赤い三角ボタンのメニューから対応するオプションを選択します。

より詳細な情報が必要な場合や、質問があるときは、JMPユーザーコミュニティで答えを見つけましょう (community.jmp.com).