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公開日: 04/21/2025

「マーカーの統計量」レポートとオプション

「マーカーの統計量」のレポートでは、データテーブルに含まれる2アレルマーカー(bialleic marker)が分析されます。「マーカーの統計量」のレポートでは、単一マーカーに関する各種指標が計算されます。また、連鎖不平衡に関する各種指標も計算されます。

「マーカーの統計量」の赤い三角ボタンのメニューには、以下のオプションがあります。

水準表

このオプションを選択すると、「マーカーの統計量」プラットフォームの別例が表示されます。「水準表」は、マーカーごとに水準数(マーカーごとの観測された遺伝子型の数)を示した表です。

度数表

このオプションを選択すると、度数表が表示されます。「度数表」は、マーカーごとに、各遺伝子型の個体数をまとめたものです。

結果の表

このオプションを選択すると、結果の表が表示されます。

p値プロット

このオプションを選択すると、Hardy-Weinberg平衡 FDR対数価値プロットが表示されます。

LD減衰プロット

このオプションを選択すると、LD減衰プロットが表示されます。

メモ: このオプションは、1つ以上の列を[with マーカー]に指定した場合のみ使用できます。

結果の表を保存

このオプションを使用すると、「結果の表」がJMPデータテーブルとして保存されます。

マーカー欠測割合の保存

このオプションを使用すると、元のデータテーブルにマーカー欠測割合を保存した列が追加されます。

条件による選択

このオプションを使用すると、「結果の表」から、指定の条件に従ったマーカーを抽出できます。

列の選択

「結果の表」で行を選択し、このオプションを使用すると、元のデータテーブで対応する列が選択されます。

マーカーの再コード化

元のデータテーブルで選択されているマーカー列について、メジャーアレルとマイナーアレルの数値を入れ替えます。

マーカーを選択して再コード化

再コード化したいマーカーの条件を入力できる新しいダイアログウィンドウが開きます。呼び出されたダイアログにて条件を入力して、[OK]をクリックすると、その条件を満たすマーカーが再コード化されます(マイナーアレルとメジャーアレルが入れ替えられます)。

より詳細な情報が必要な場合や、質問があるときは、JMPユーザーコミュニティで答えを見つけましょう (community.jmp.com).