マーカーの遺伝的混合

「マーカーの遺伝的混合」プラットフォームは、ある特定の集団におけるマーカー遺伝子型のデータから、「各個体に対して、複数の異なる祖先集団がどれぐらい寄与しているか」を表す混合確率を推定します。

このプラットフォームは、複数の異なる祖先集団から派生したであろう集団のマーカー遺伝子型データを分析対象とします。マーカー遺伝子型データからまず行列Fを作成し、F=PQの形で行列分解します（Cabreros and Storey, 2019）。Pの各行は、各マーカーのアレルが該当の祖先集団においてどれぐらいの割合だけ分布しているかの確率を表しています。また、Qの各列は、各個体が該当の祖先集団に所属する混合確率として解釈できます。

図6.1 「マーカーの遺伝的混合」プラットフォームの例