マーカーの関係性

「マーカーの関係性」プラットフォームは、遺伝子マーカーのデータから、個体間の遺伝的関係性（genetic relatedness）を求めます。このプラットフォームは、n行 × n列（n = データテーブルの個体の数）のゲノム関係行列（genomic relationship matrix）を作成します。作成されたゲノム関係行列は、「モデルのあてはめ」プラットフォームの［応答のスクリーニング］手法において、GBLUPモデルをあてはめる際に利用できます。また、ゲノム関係行列に対して主成分分析やクラスター分析などを行うことで、関係が近い個体のクラスターを見つけ出すこともできます。

図5.1 「マーカーの関係性」プラットフォームの例 

「マーカーの関係性」プラットフォームは、JMP Proでのみ使用できます。

目次

「マーカーの関係性」の例

「マーカーの関係性」プラットフォームの起動

「マーカーの関係性」プラットフォームに必要なデータ形式

「マーカーの関係性」レポートとオプション

ダイアログのオプションの要約

散布図行列

主成分分析プロット

階層型クラスター分析

「マーカーの関係性」プラットフォームの別例